بما أن السؤال يطرح تعارض الغيبة مع نظرية الإمامة بشكل كلي دون الإشارة إلى المصاديق، فلابد من الإشارة إلى ذكر عناوين وظائف الإمام، ثم نرى و بشيء من التحليل، هل إن هذه الوظائف تنسجم مع دور الإمام في الغيبة أم لا؟

الإمامة هي استمرار للنبوة و امتداد لها و لكن دون نزول الوحي و هذا هو الفارق الوحيد بين المفهومين. و الإمام يؤدي جميع وظائف النبي الأساسية و من أهمها:

1- إقامة الحكومة الإلهية و تحرير الناس من سلطان الظلم و الجور. و بما أن الحكومة هي فعالية اجتماعية بقيادة شخص يلقى القبول من أفراد المجتمع، و لذلك فلا يمكن أن نطلب من القائد في أوساط المجتمع أن يقيم حكومة في ظل أي ظروف و أوضاع تسود الأمة و تحكم الواقع الاجتماعي، و لهذا نجد أن الرسول الأكرم (ص) لم يقدم على مثل هذا العمل قبل الهجرة إلى المدينة، ومع ذلك لا يعد هذا خللاً في نبوته، و إنما يكشف عن عدم ملائمة الظروف و مواتاة الأجواء الاجتماعية لقبول مثل هذا العمل الكبير.

و هكذا الأمر بالنسبة لغيبة الإمام الثاني عشر فإن الأمر مشابه لما كان عليه في صدر الإسلام.

إنه عصر مليء بالاضطرابات و الفتن الشاملة. و عليه فطلب النهوض و الثورة من الإمام الثاني عشر (ع) في ظل هذه الظروف يعد مطلباً لا عقلائياً. و من جهة أخرى فإن من أبرز خصائص ثورة الإمام (ع) إقامة أساس العدل و الإنصاف.

فغيبة الإمام لا تتنافى مع وظيفته الأولى إذاً، و إنما تكشف عن انحسار الدين و تأثيره و ضعف الناس و خورهم و قصورهم عن قبول الحكومة الإسلامية.

2- بيان المعارف الإلهية و إرشاد الناس. هذه هي المهمة الثانية بالنسبة إلى الإمام، و التي تؤدى على نحويين، تارة بشكل مباشر و أخرى بصورة غير مباشرة. كما كان رسول الله (ص) يفعل ذلك فعندما تحول العقبات و المصاعب بينه و بين الناس، أو عدم قدرة الناس و تمكنهم من الوصول إليه، فإنه يختار رجالاً من أهل التقوى و العلم و الاطلاع بأمور الإسلام و يرسلهم للقيام بمهمة إرشاد الناس و توعيتهم، و هذا عين ما قام به الإمام الثاني عشر (عج) حيث نصب النواب والسفراء الخاصين في عصر الغيبة الصغرى، و النواب العامين في عصر الغيبة الكبرى ليكونوا واسطة بينه وبين الناس. هذه نماذج من وظائف الإمام و قد ثبت أنها لا تتعارض مع الغيبة.

و أما ألطاف الإمام و بركاته فهي أوسع و أشمل من وظائفه، و لا تنحصر في الإمام الحاضر أو الغائب.

و لابد من القول أن الإمام هو روح العالم و القطب الذي تدور عليه السماوات و الأرض، على نحو أوضحه أهل بيت الرسول الأكرم (ص) بأقوال و أحاديث كثيرة مؤداها أنه لو لم يكن الإمام موجوداً "لولا الحجة لساخت الأرض بأهلها". فالإمام هو السبب المتصل بين الأرض و السماء و هو مجرى نزول البركات الإلهية. دعاؤه مستجاب و نواياه كلها خير و بركة. و نجد هذا لمورد يتكرر في زيارات أئمة الهدى كثيراً.

إن عباد الله يواجهون أعداءً أقسموا على المواجهة و على رأسهم إبليس. و إن الإمام (ع) - و عن طريق آثاره و تصرفه القدسي في النفوس - يحول بينهم و بين الوقوع في الكثير من الحبائل و المصائد و ينجيهم من كثير من البلايا و يهديهم إلى سبيل الرشاد.  هذا هامش من عوائد و فوائد و بركات الإمام الغائب الذي أشار إليها الرسول الأكرم (ص) في روايته المعروفة حينما وصف الإمام بالشمس التي تحتجب وراء الغيوم، و مع أن الناس لا يرون الإمام و لا هو حاضر بشكل كامل بين ظهرانيهم، إلا أنه يغمرهم بفيض وجوده المليء بالفوائد و العوائد.